房屋买卖协议无效时，房管局能否撤销你善意取得的房权证，需视具体情况而定。

首先，我们要明确一点，当法院判定房屋买卖合同无效后，基于该合同而进行的产权变更就失去了合法的依据。然而，能否直接撤销产权，还需要综合考量多种因素，特别是是否存在善意第三人的合法权益。

1. 若你属于善意第三人：

   • 在法律上，善意第三人是指在不知情的情况下，通过合法途径取得财产权益的第三人。如果你是在不知情且合法的情况下取得了房权证，那么你的权益是受到法律保护的。
   • 在这种情况下，即使房屋买卖合同被判定为无效，房管局也不能直接撤销你的房权证，除非有充分的证据证明你并非善意取得。

2. 若不存在善意第三人或存在其他复杂情况：

   • 如果不存在善意第三人的情况，或者案件涉及其他复杂因素（如房屋已被抵押、存在其他权利负担等），那么房管局在接到法院的有效判决后，可能会根据具体情况来决定是否撤销房权证。
   • 在这种情况下，可能需要进一步通过法律程序来解决产权问题，确保各方的合法权益得到妥善处理。

综上所述，房屋买卖协议无效时，房管局能否撤销你善意取得的房权证并不是一个简单的“是”或“否”的问题。它取决于多种因素的综合考量，特别是你是否属于善意第三人。因此，如果你面临这样的情况，建议尽快咨询专业律师（比如我），以便根据你的具体情况提供针对性的法律建议和帮助。