企业管理人员住房租金由企业承担并不直接构成违法。这一问题的合法性主要取决于企业内部的管理规定、劳动合同约定以及相关的税务处理是否合规。下面我将从几个角度进行详细分析：

1. 企业内部管理规定：

   • 企业有权根据自身的经营状况和财务状况，制定合理的管理规定，包括是否为员工（包括管理人员）提供住房租金补贴或承担其住房租金。
   • 如果企业内部有明确的规定，且该规定不违反国家法律法规，那么按照规定执行即可。

2. 劳动合同约定：

   • 劳动合同是企业和员工之间建立劳动关系的法律依据。
   • 如果劳动合同中明确约定了企业将为员工（包括管理人员）承担住房租金，那么这一约定是具有法律效力的。
   • 如果劳动合同中没有相关约定，但企业后续决定承担某员工的住房租金，这也需要通过双方协商一致，并可能需要以书面形式进行确认。

3. 税务处理：

   • 企业承担员工住房租金可能涉及税务问题，如是否需要计入员工个人所得、是否需要代扣代缴相关税费等。
   • 企业应确保在税务处理上合规，避免因税务问题而引发法律风险。

4. 合规性考量：

   • 虽然企业承担员工住房租金本身不违法，但企业应确保这一做法不会引发其他合规问题，如是否涉嫌利益输送、是否违反公平竞争原则等。

综上所述，企业管理人员住房租金由企业承担并不直接构成违法，但企业应确保这一做法符合内部管理规定、劳动合同约定以及税务处理的要求，并避免引发其他合规问题。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。