在商品预售房合同纠纷中，需要准备的证据主要包括三大类：商品房预售合同关系的证据、合同履行情况的证据以及其他证明案件事实的证据。

一. 商品房预售合同关系的证据

1. 商品房预售合同及其登记备案情况的证据：这是最直接证明双方存在预售合同关系的文件，包括合同本身以及在相关部门进行登记备案的相关文件资料。
2. 商品房预售项目的相关许可证：包括土地使用权证、建设工程规划许可证、商品房预售许可证等，这些证明文件用于确认预售项目的合法性和合规性。

二. 合同履行情况的证据

1. 支付购房款的相关证据：具体金额、时间节点、支付方式，以及是否存在未足额支付或拖欠购房款的情况，这些都是证明合同履行情况的关键证据。
2. 房屋交付及产权办理情况：关于交付房屋及办理房屋产权证、土地使用权证的相关信息，包括未能如期交付房屋并办理相应证件的原因、理由等详细说明。
3. 商品房质量与面积的证据：针对商品房的质量状况、建筑面积等相关问题的证据，以及对这些问题提出异议的相关材料。

三. 其他证明案件事实的证据 这可能包括当事人的陈述、视听资料、电子数据、证人证言、鉴定意见、勘验笔录等，这些证据可以进一步补充和证明案件的事实情况。

我建议在准备这些证据时，务必确保它们的真实性、合法性和关联性，以便在纠纷解决过程中发挥最大的作用。同时，如有进一步需要，您可以继续咨询我。