针对您提出的“双方股权转让协议纠纷在法院调解好了之后，原告并未进行股权转让协议怎么办”的问题，我给出如下分析和建议：

首先，我们需要明确的是，法院调解书是有法律效力的，必须履行。如果原告在调解后并未按照约定进行股权转让，那么这实际上构成了对调解书的违约。

1. 法律后果：

   • 被告有权向法院申请强制执行。一旦申请被受理，法院有权采取很多强制措施，像是冻结银行账户、查封财产等，甚至可能被追究刑事责任。
   • 原告可能会因此承担额外的违约责任，比如支付违约金、赔偿损失等。

2. 解决建议：

   • 主动沟通：建议原告尽快与被告进行沟通，解释原因，并寻求解决方案。如果双方能够达成一致，可以签订补充协议，明确新的履行方式和时间。
   • 履行调解书：如果沟通无果，原告应当尽快按照调解书的要求履行股权转让义务，以避免不必要的法律纠纷和损失。
   • 法律咨询：如果原告在履行过程中遇到法律问题或困惑，可以及时向我咨询，我会提供专业的法律建议和支持。

3. 预防措施：

   • 在签订股权转让协议和调解书时，应当谨慎考虑，确保条款清晰、明确，并预留足够的履行时间和方式。
   • 在履行过程中，应当及时与被告保持沟通，确保双方对履行进度和方式有明确的了解。

总之，法院调解书是有法律效力的，必须履行。如果原告未按照约定进行股权转让，可能会面临严重的法律后果。因此，建议原告尽快与被告沟通、履行调解书，并在必要时寻求专业的法律咨询和支持。