关于生产、销售伪劣种子罪的立案标准，以下是对此问题的清晰、详细且有深度的解答：

一、立案标准的法律依据

根据最高人民法院、最高人民检察院《关于办理生产、销售伪劣商品刑事案件具体应用法律若干问题的解释》（法释〔2001〕10号）以及《最高人民检察院公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》的相关规定，生产、销售伪劣种子罪的立案标准主要基于生产损失的大小。

二、具体的立案标准

1. 使生产遭受较大损失：

   • 损失金额一般以二万元为起点。即，如果生产、销售伪劣种子的行为导致生产损失达到或超过二万元，即符合立案标准。

2. 使生产遭受重大损失：

   • 损失金额一般以十万元为起点。这种情况下，不仅达到立案标准，而且量刑会更重。

3. 使生产遭受特别重大损失：

   • 损失金额一般以五十万元为起点。这是最为严重的情形，将面临更严厉的刑罚。

三、犯罪构成与认定

1. 犯罪客体：

   • 本罪侵犯的是国家对农用生产资料质量的监督管理制度和农业生产。生产、销售伪劣种子的行为严重破坏了农业生产，对农业造成重大危害。

2. 犯罪结果：

   • 本罪为结果犯，即必须造成生产遭受较大损失的结果。如果仅有生产、销售行为而未造成实际损失，或者损失未达到较大损失的程度，则不构成此罪。

3. 主观要件：

   • 本罪的主观方面是故意，即行为人明知是伪劣种子而仍然生产、销售，并希望或放任危害结果的发生。

4. “假劣”的认定：

   • 本罪中的“假劣”种子不完全等同于行政法规中的“假劣”认定。重点是种子是否失去使用效能，即是否因过期、受潮、变质等原因无法产生应有的效果。

四、其他相关情况

1. 销售金额与未销售货值金额：

   • 在某些情况下，即使生产、销售的伪劣种子未直接造成生产损失，但如果销售金额或未销售的货值金额达到一定标准（如销售金额五万元以上或未销售货值金额十五万元以上），也可能构成生产、销售伪劣产品罪。

2. 特殊情节：

   • 如果生产、销售伪劣种子的行为对人体健康造成严重危害、造成重大财产损失或具有其他恶劣影响，即使未达到上述金额标准，也可能被立案追诉。

综上所述，生产、销售伪劣种子罪的立案标准主要基于生产损失的大小，并考虑其他相关情节。在司法实践中，司法机关会根据案件的全部事实和证据来准确确定是否达到立案标准，并综合考虑犯罪的具体情节进行量刑。