巡察发现的违法案件，其处理流程通常遵循一系列严谨且有序的步骤，以确保案件的公正、合法和高效处理。以下是对这一流程详细且深入的解答：

一、接收与登记/初步评估

当巡察组收到违法案件的相关材料和反映时，首先会进行详细登记或初步评估。这一步骤涉及记录案件的基本信息，如反映人的身份信息、案件的主要内容、涉及的单位或人员、时间地点以及可能的证据线索。这一环节的目标是确保信息的准确性和完整性，为后续处理奠定坚实基础。

二、初步研判/立案决定

接下来，巡察组会安排专业人员对案件进行初步分析和研判。这一过程中，会判断案件是否属于巡察组的受理范围，以及案件是否具有重要性、典型性和紧迫性。如果案件被认为具有可查性且符合巡察组的职责范围，将会作出立案决定，并正式启动调查程序。

三、分类处理

根据案件的性质和严重程度，巡察组会进行分类处理：

• 对于涉及领导干部严重违纪违法等重大问题线索，巡察组会及时将其移交给纪检监察机关进行处理。
• 如果案件属于被巡察单位的业务范畴但存在工作不力等情况，巡察组会提出整改要求，并对整改情况进行督办。
• 对于涉及其他部门职责的问题，巡察组会将案件材料转交给相关职能部门处理，并要求其反馈处理结果。

四、调查取证

立案后或根据需要，巡察组将组织专业人员进行深入的调查取证工作。这一环节包括查阅资料、询问证人、现场勘查等多种方式，以全面、深入地收集证据，支持案件的进一步处理。

五、分析研判

在收集到足够的证据后，巡察组会对案件进行深入的分析研判。这一过程中，会明确问题的性质、责任主体以及可能涉及的法律法规，为形成调查报告和处理建议提供依据。

六、形成报告

根据调查结果和分析研判，巡察组会形成详细的调查报告。报告将全面阐述案件的事实、证据、问题性质以及处理建议，为后续移交处理提供有力支撑。

七、移交处理

调查报告完成后，巡察组会将案件及相关材料移交给有处理权限的机关或部门进行处理。这些机关或部门可能包括纪检监察机关、司法机关或其他相关部门。移交处理的目的是确保案件得到依法依规的处理。

八、整改与反馈

被巡察单位针对巡察组指出的问题和提出的整改要求，需要积极开展整改工作，并通过完善制度、加强管理等措施解决案件中暴露出来的问题。相关部门在完成案件调查处理后，也需将处理结果反馈给巡察组，巡察组再向反映人进行反馈，确保事事有回音、件件有着落。

九、总结与监督

最后，巡察组会对案件处理情况进行总结分析，发现共性问题和制度漏洞，为完善相关政策、加强监督管理提供参考。同时，巡察组还会持续对整改情况进行监督检查，防止问题反弹，确保整改取得实效。

综上所述，巡察发现的违法案件处理流程是一个严谨、有序且全面的过程，旨在确保案件的公正、合法和高效处理。在实际操作中，具体的处理流程可能因地区、机构及案件性质的不同而有所差异，因此应参照当地的相关规定和程序进行操作。