针对虚开普通发票6000元的情况，处理方式主要依据相关法律法规及税务部门的规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律性质与后果：

   • 虚开发票，无论是增值税专用发票还是普通发票，都违反了税收管理法规，属于违法行为。
   • 虚开发票的金额达到一定数额，可能构成犯罪，需承担刑事责任。对于普通发票，虽然不像增值税专用发票那样有严格的刑事立案标准，但虚开行为仍可能受到行政处罚，如罚款、没收违法所得等。

2. 具体处理方式：

   • 主动补缴与改正：如果虚开行为被及时发现，且尚未造成严重后果，纳税人可以主动向税务部门报告，补缴税款，并接受相应的行政处罚。
   • 配合调查：税务部门在发现虚开行为后，会进行调查。纳税人应积极配合，提供相关资料，如实说明情况。
   • 接受处罚：根据虚开行为的性质、情节和后果，税务部门会依法作出处罚决定。纳税人应接受处罚，并按时缴纳罚款。

3. 预防与建议：

   • 加强财务管理和内部控制，确保发票的真实性和合法性。
   • 定期对财务人员进行税法培训，提高税法意识和遵法守规的自觉性。
   • 如遇税务问题或疑问，应及时咨询税务部门或专业律师，避免违法风险。

综上所述，虚开普通发票6000元，虽不一定构成犯罪，但仍属于违法行为，需承担相应的法律责任。建议纳税人及时补缴税款，接受处罚，并加强财务管理和内部控制，以预防类似问题的再次发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。