公司注销后，其法人股东也注销了，一般不可以进行二次穿透。下面我将详细解释这一结论：

首先，我们要明确“二次穿透”的含义。在公司法务中，二次穿透通常指的是在某种法律结构或交易安排中，穿透两层或更多层的法律实体，以追溯或确认最终的法律关系或责任主体。然而，在公司注销的情况下，公司的法人资格已经消灭，其股东也随之失去了与公司相关的法律地位。

接下来，我们分析公司注销后法人股东也注销的情况。当公司注销时，其所有的法律关系和责任都会得到清算和处理。如果公司的法人股东在公司注销后也注销了，那么这两个法律实体都已经不存在了，它们之间的法律关系和责任也就无从谈起。因此，在这种情况下，进行二次穿透在法律上是没有依据的。

此外，从法律实践的角度来看，即使公司的法人股东在公司注销后没有立即注销，但在一定时间内（如清算期）后也注销了，那么想要进行二次穿透也会面临极大的困难。因为此时两个法律实体都已经不存在了，相关的法律文件和记录可能已经无法查找或已经失效。

综上所述，公司注销后，其法人股东也注销了，一般不可以进行二次穿透。如果涉及到相关的法律纠纷或争议，建议根据具体的法律事实和法律规定进行处理和解决。如果你还有其他关于公司法务的问题，可以直接向我咨询。