休年休假不应扣除绩效奖金。以下是对这一结论的详细解释：

1. 法律依据：

   • 根据《职工带薪年休假条例》第二条，职工连续工作1年以上即享受带薪年休假，且年休假期间应享受与正常工作期间相同的工资收入。这表明，绩效奖金作为工资的一部分，在职工休年假期间不应被扣除。
   • 《中华人民共和国劳动合同法》第四条也强调，涉及劳动报酬的规章制度需经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。若用人单位欲扣减休年假期间的绩效工资，必须确保该规定经过合法程序制定并已告知劳动者，否则该规定无效。

2. 企业常见做法：

   • 大多数规范的企业会遵循法律法规，保障员工休年假的权益，不会因员工休年假而扣除其绩效奖金。
   • 部分企业可能会根据绩效考核周期和年假管理制度进行相应调整，但这种调整需要明确制度依据，并向员工进行公示和说明。

3. 特殊情况：

   • 如果员工在休年假过程中违反了公司规定，如未按规定流程申请年假或从事与公司业务相竞争的活动，公司可能会根据内部规章制度对员工进行处罚，包括扣除部分绩效奖金。但这种扣除需要有明确的制度依据和合理的事实理由。
   • 在企业经营困难的情况下，可能会出现无法按时足额支付员工工资和绩效奖金的情况。但即便如此，企业也不能单纯以员工休年假为由扣除绩效奖金。

综上所述，休年休假是劳动者的法定权利，期间不应被扣除绩效奖金。如果用人单位在职工休年假期间扣除了绩效奖金，劳动者可以与用人单位进行沟通协商，要求其纠正不合理做法。协商不成时，劳动者可向劳动行政部门投诉，或通过劳动争议调解委员会进行调解，甚至依法申请仲裁或提起诉讼以维护自己的合法权益。