屠宰企业升级改造时选择另外选址是合法的，但前提是必须符合相关法律法规和规划要求。具体来说，有几个关键点需要注意：

1. 符合国土空间规划：

   • 屠宰企业的选址和建设应当符合当地的国土空间规划。这意味着在选址前，企业需要了解并遵循当地政府对土地使用的规划和要求。

2. 遵守法律法规：

   • 屠宰企业的建设和运营必须遵守国家及地方的相关法律法规，包括但不限于《中华人民共和国畜牧法》、《中华人民共和国土地管理法》等。这些法律对土地使用、建设要求、环保标准等都有明确规定。

3. 不在禁养区域建设：

   • 根据《中华人民共和国畜牧法》的规定，畜禽养殖场的选址不得违反法律法规，在禁养区域建设畜禽养殖场是违法的。因此，屠宰企业在选址时也应避免禁养区域。

4. 办理相关手续：

   • 如果屠宰企业需要在农用地上兴建永久性建（构）筑物，那么必须依照《中华人民共和国土地管理法》的规定办理农用地转用手续。此外，还可能涉及环保、消防、安全等多个部门的审批和监管。

5. 考虑市场需求和产能：

   • 在选址时，屠宰企业还需要考虑市场需求和产能因素。例如，新会区在优化生猪定点屠宰厂（场）布局时，就进行了市场需求分析，以确保屠宰企业的产能能够满足市场需求。

综上所述，屠宰企业升级改造时选择另外选址是合法的，但前提是必须符合相关法律法规和规划要求，并办理好相关手续。同时，企业还需要考虑市场需求和产能因素，以确保选址的合理性和可行性。