当公司有司法案件时，是否还能申请成为高新技术企业（高企），这个问题需要从多个角度来分析。

1. 法律层面：从法律的角度来看，公司存在司法案件并不直接决定其能否申请高企。高企的认定主要依据的是公司的技术创新能力、研发投入、高新技术产品（服务）收入占比等因素，而非其是否涉及司法案件。因此，仅从法律层面讲，有司法案件的公司仍然有资格申请高企。

2. 实际申请过程：然而，在实际申请过程中，公司的司法案件情况可能会被视为一个评估因素。如果案件涉及公司的诚信问题、知识产权纠纷或严重违法行为，这可能会对公司的高企申请产生负面影响。评审机构可能会担心这些案件会影响公司的持续创新能力、经营稳定性或声誉，从而拒绝或暂缓其高企申请。

3. 建议与应对：对于有司法案件的公司来说，如果想要申请高企，建议首先评估案件的性质和可能对公司产生的影响。如果案件较轻且对公司的高新技术业务无直接影响，那么可以积极准备高企申请材料，突出公司的技术创新优势和研发实力。如果案件较为严重或可能对公司产生较大影响，那么建议公司在处理完相关案件后再进行高企申请，或者在申请过程中详细说明案件情况，并提供相应的证明材料以证明公司仍然具备高企的认定条件。

综上所述，公司有司法案件并不直接决定其能否申请高企，但可能会在实际申请过程中产生一定影响。因此，建议公司在申请前仔细评估自身情况，并咨询相关部门或专业人士的意见。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。