如果农村的树被工厂毁了，你可以采取以下措施来维护自己的权益：
首先，明确结论：你需要及时收集证据，并与工厂进行协商或寻求法律援助，以要求工厂承担相应的赔偿责任。
接下来，是具体的处理步骤和建议：
收集证据：
- 拍照或录像：确保记录下树木被毁的实际情况，包括损毁程度、位置等。
- 证人证言：如果可能，寻找目击者或了解情况的村民，让他们提供证言。
- 相关文件：收集与树木相关的所有权证明、土地证明等文件。
与工厂协商：
- 在收集到足够证据后，首先尝试与工厂进行友好协商，看是否能够达成赔偿协议。
- 协商时，要清晰、明确地表达你的诉求和依据，同时保持冷静和理智。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，你可以考虑寻求法律援助，通过法律途径来维护自己的权益。
- 可以咨询当地的律师或法律援助机构，了解具体的法律程序和操作方法。
提起诉讼：
- 在必要时，你可以向法院提起诉讼，要求工厂承担侵权责任。
- 在诉讼过程中，你需要提供充分的证据来证明工厂的侵权行为以及你的损失。
可能的法律后果：
- 如果法院认定工厂存在侵权行为，工厂可能需要承担赔偿责任，包括树木的价值、你的精神损失等。
- 同时，工厂还可能面临其他法律后果，如行政处罚、声誉损失等。
最后，一些额外的建议：
- 在处理此类问题时，务必保持冷静和理智，避免采取过激行为。
- 如果可能，可以寻求当地村委会或相关部门的帮助和支持。
- 对于法律程序不熟悉的情况，务必咨询专业律师或法律援助机构，以确保自己的权益得到充分保障。
我是史亮律师，专注于建设工程、合同纠纷、公司事务、知识产权、刑事辩护、侵权纠纷等领域。如果你在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，都可以直接向我咨询。