若农田树木被破坏，首先应明确破坏主体与性质，再根据不同情况采取相应法律措施，具体如下：
破坏主体与性质认定
- 自然因素破坏：若因自然灾害（如台风、洪水）或不可抗力导致树木损毁，通常不涉及法律责任，但可依据农业保险合同申请理赔（如有投保）。
- 人为故意破坏：若为他人故意损毁（如砍伐、焚烧），则可能构成侵权或违法犯罪行为，需进一步区分行为性质：
- 民事侵权：破坏者需承担赔偿损失、恢复原状等民事责任（《民法典》第1165条、第1184条）。
- 行政违法：若破坏行为违反《森林法》《土地管理法》等行政法规（如未取得采伐许可证砍伐林木），可能面临行政处罚（如罚款、责令补种树木）。
- 刑事犯罪：若破坏行为情节严重（如盗伐林木数量较大、故意毁坏公私财物数额较大），可能构成盗伐林木罪、故意毁坏财物罪等（《刑法》第275条、第345条）。
应对措施与程序
- 固定证据：立即拍摄现场照片、视频，记录破坏时间、地点、破坏范围及破坏者信息（如车牌号、外貌特征）；若可能，联系村委会或邻居作为证人。
- 报警处理：若怀疑为人为故意破坏，第一时间向当地公安机关报案，要求立案侦查（尤其涉及刑事犯罪时）。
- 行政投诉：若破坏行为违反行政法规（如非法占用农田、无证采伐），可向当地林业部门、自然资源部门或农业农村部门投诉，要求行政查处。
- 民事索赔：若破坏者明确，可直接向法院提起民事诉讼，要求赔偿树木价值、恢复费用及间接损失（如因树木毁损导致的农田减产损失）；赔偿标准可参考当地林业部门发布的林木价值评估标准或委托专业机构评估。
特殊情形处理
- 集体所有农田树木：若树木为村集体所有，需由村委会代表集体主张权利；个人不得擅自处置集体财产。
- 承包经营权争议：若树木位于承包地内，且承包合同对树木权属有约定，需按合同约定处理；若无约定，可能涉及承包方与发包方的权属争议，需通过协商、调解或诉讼解决。
- 生态补偿与修复：若破坏行为导致生态环境损害（如水土流失、生物多样性破坏），可依据《民法典》第1234条要求破坏者承担生态修复责任，或向生态环境损害赔偿资金账户申请修复资金。
建议：根据破坏程度与性质，优先通过报警、行政投诉固定证据并追究责任；若损失较大或涉及刑事犯罪，务必及时委托律师介入，以最大限度维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。