结论前置：借四千两年的利息是1000元，是否合法需根据具体情况判断，主要看利息是否超过了法律规定的上限。

分析说明：

1. 利息合法性的判断标准：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，民间借贷的利率可以适当高于银行的贷款利率，但不得违反国家有关规定，即不得高于银行同类贷款利率的四倍（该标准可能因地区、时间等因素有所调整，具体以当地法院或相关机构的规定为准）。
   • 如果借四千元两年的利息是1000元，我们需要计算这两年的年利率，并与银行同类贷款利率的四倍进行比较。

2. 具体计算：

   • 假设银行同类贷款年利率为X%，则两年的利息上限为：4000元 × X% × 2年 × 4 = 320X元。
   • 如果1000元利息未超过320X元，则利息合法；如果超过，则可能被视为高利贷，不受法律保护。

3. 实际操作的建议：

   • 在签订借款合同时，应明确约定借款金额、利息、还款期限等条款，并确保利息符合法律规定。
   • 如果遇到高利贷或不合法的借贷行为，应及时向有关部门举报或寻求法律援助。

总结：借四千两年的利息是1000元是否合法，取决于具体的银行同类贷款利率以及当地的法律规定。在签订借款合同时，务必谨慎审查合同条款，确保借贷行为的合法性。如有疑问，可直接向我咨询。