将服务费抵扣房费的做法并不合法。下面我来详细解释一下：

首先，从法律角度来看，服务费与房费是两种性质完全不同的费用。服务费是房地产经纪人为提供中介服务（如房源介绍、合同签订等）而收取的报酬，而房费则是房屋使用者为使用房屋而支付的费用。这两者之间在法律上没有直接的抵扣关系。

其次，如果房地产经纪人擅自将服务费抵扣房费，这可能会构成不当得利或侵犯消费者权益的行为。不当得利是指没有法律根据，使他人受到损失而自己获得了利益。在这种情况下，房地产经纪人没有合法依据将服务费抵扣房费，从而可能使房屋使用者受到经济损失，而自己则获得了不应得的利益。同时，这种行为也可能违反了消费者权益保护法的相关规定，侵犯了消费者的合法权益。

因此，我建议你在与房地产经纪人交易时，应明确区分服务费与房费，并按照合同约定或法律规定支付相应的费用。如果房地产经纪人提出将服务费抵扣房费的要求，你可以明确拒绝，并要求其按照合同约定或法律规定执行。如果因此产生纠纷，你可以向相关部门投诉或寻求法律帮助。