双方协商虚开发票造成的损失，一般应由双方根据各自的责任大小共同承担。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律责任分析：

   • 虚开发票是违法行为，不仅违反了税收管理法规，还可能构成犯罪。因此，双方首先应承担相应的法律责任，包括可能的罚款、补缴税款、滞纳金以及可能的刑事责任。
   • 在双方协商虚开发票的过程中，通常存在一方提议或主导，另一方配合或默许的情况。根据各自的行为性质和情节，双方的责任大小可能有所不同。

2. 损失承担原则：

   • 根据民法中的公平原则和过错责任原则，双方应根据各自在虚开发票行为中的过错程度和造成的损失大小，承担相应的损失赔偿责任。
   • 如果一方是主导者或提议者，且其行为对损失的发生起到了决定性作用，那么该方应承担更大的损失赔偿责任。
   • 如果另一方虽然配合或默许了虚开发票行为，但并未直接参与或主导，且对损失的发生贡献较小，那么其承担的损失赔偿责任应相对较轻。

3. 具体损失的计算与分担：

   • 双方应首先明确因虚开发票造成的具体损失，包括税款损失、滞纳金、罚款以及因此产生的其他直接和间接损失。
   • 在确定损失后，双方可以协商如何分担这些损失。协商不成时，可以通过诉讼或仲裁等方式解决争议。

4. 法律建议：

   • 双方应充分认识到虚开发票的严重性和违法性，避免再次发生类似行为。
   • 在处理因虚开发票造成的损失时，应秉持公平、公正的原则，通过协商或法律途径解决争议。
   • 如需进一步了解相关法律规定或寻求法律帮助，请直接向我咨询。

综上所述，双方协商虚开发票造成的损失应由双方根据各自的责任大小共同承担。在处理此类问题时，应充分考虑双方的过错程度和造成的损失大小，并遵循公平、公正的原则进行协商或诉讼。