关于“代理公司业主是否可以指定”的问题，我们可以从相关的法律法规中找到明确的答案。

首先，《中华人民共和国招标投标法》第十二条明确规定：“招标人有权自行选择招标代理机构，委托其办理招标事宜。任何单位和个人不得以任何方式为招标人指定招标代理机构。”这一条款明确保护了招标人在选择招标代理机构时的自主权，并禁止了任何形式的外部干预。

进一步地，《招标投标领域公平竞争审查规则》第五条也强调了政策制定机关应当尊重和保障招标人在组织招标、选择招标代理机构等方面的自主权，不得制定为招标人指定招标代理机构或违法限定招标人选择招标代理机构方式的政策措施。

此外，《国家发展改革委等部门关于严格执行招标投标法规制度进一步规范招标投标主体行为的若干意见》也再次重申了这一点，即任何单位和个人都不得以任何方式为招标人指定招标代理机构，也不得强制具有自行招标能力的招标人委托招标代理机构办理招标事宜。

综上所述，根据这些法律法规和政策文件的规定，我们可以清晰地得出结论：代理公司业主（即招标人）有权自行选择招标代理机构，并且这一选择权受到法律的保护，任何单位和个人都不得进行干预或指定。因此，代理公司业主是可以指定的，但这一指定权完全掌握在业主自己手中，不受外部因素的影响。