交通事故车速鉴定机构理论上是可以自己选择的。根据《交通事故处理程序规定》的相关规定，具备资格的检验、鉴定、评估机构应当向省级人民政府公安机关交通管理部门备案，而公安机关交通管理部门可以向当事人介绍符合条件的检验、鉴定、评估机构，并允许当事人自行选择。

在实际操作中，通常是由交警部门委托有相应资质的司法鉴定机构进行车速鉴定。这些机构配备专业的鉴定设备和技术人员，能够按照相关标准和规范准确完成鉴定工作。然而，如果你对交警部门推荐的鉴定机构有疑虑，或者希望选择自己认为更可靠的机构，你是有权自行选择的。

在选择鉴定机构时，需要确保所选机构具有合法的资质和良好的信誉。可以通过查询相关部门的备案信息、了解机构的业绩和口碑等方式进行筛选。同时，在鉴定过程中，各方应积极配合，提供必要的车辆信息、事故现场资料等，以确保鉴定结果的客观性和公正性。

需要注意的是，虽然当事人可以自行选择鉴定机构，但鉴定结果仅作为参考或依据，并不能直接作为最终定案的全部证据。如果警方或其他相关方对鉴定结果有异议，还可以重新请鉴定机构进行鉴定。在赔偿等争议解决过程中，鉴定结果将作为有力证据之一，但并非唯一决定因素。

综上所述，交通事故车速鉴定机构是可以自己选择的，但在选择过程中应谨慎筛选，并确保鉴定过程的客观性和公正性。