员工辞职的时候，工资应当结清。这是根据《工资支付暂行规定》第九条明确规定的，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。下面我详细解释一下这个规定以及实际操作中的一些情况：

1. 法律规定：

   • 根据《工资支付暂行规定》，无论员工因何种原因离职，只要其已按照法律规定提前通知了用人单位，离职时就有权要求用人单位结清所有应得的工资报酬。

2. 实践中的操作：

   • 立即结清：在员工与用人单位就离职事宜达成一致，并办理完工作交接等手续的情况下，许多单位会选择立即结清工资，以避免后续纠纷，维护良好的劳资关系。
   • 按照公司常规发薪日支付：部分用人单位会遵循既定的工资发放周期来支付离职员工的工资。这种做法在用人单位明确告知劳动者且不违反当地相关规定的前提下，也是被允许的。但需要注意的是，用人单位必须确保在约定的发薪日及时支付，不得恶意拖欠。

3. 员工权益保护措施：

   • 若用人单位未按规定及时支付辞职员工的工资，员工首先可以尝试与用人单位进行沟通，要求其按照法律规定及时支付工资。
   • 若协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权对用人单位进行调查和处理。
   • 员工还可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径要求用人单位支付工资及可能的经济补偿。

4. 建议与注意事项：

   • 劳动者在辞职前应确保按照法定程序提前通知用人单位，并办理好工作交接手续。
   • 劳动者应注意收集能证明自己工作时间、工作量以及工资标准等方面的证据，如考勤记录、工作成果、工资条等，以备不时之需。
   • 劳动者在入职时应详细了解用人单位的工资发放制度及相关规定，以便在离职时能够做出合理的预期和安排。

综上所述，员工辞职时，工资应当结清，这是法律对员工权益的基本保障。无论用人单位采取何种方式支付离职员工的工资，都必须确保及时、足额地支付。如果遇到用人单位拖欠工资的情况，劳动者可以采取相应的措施来维护自己的合法权益。