关于市场监管局行政处罚案件违法所得的认定，这是一个涉及多个层面和细节的问题。以下是我根据相关法律法规和现行政策，为您提供的详细解答：

一、违法所得的法律定义

违法所得，根据《行政处罚法》第二十八条的规定，是指“实施违法行为所取得的款项”。这是法律对违法所得的基本定义，也是市场监管局在行政处罚案件中认定违法所得的基础。

二、违法所得的认定原则

1. 扣除支出原则：

   • 在市场监管领域，违法所得的认定通常遵循“扣除支出原则”，即违法所得为实施违法行为所取得的全部收入扣除直接用于生产经营活动的必需支出后的余额。
   • 必需支出主要包括直接材料、人工等直接成本，这些支出是生产经营活动所必需的，因此在计算违法所得时应予扣除。

2. 不扣除例外：

   • 尽管扣除支出是原则，但也存在不扣除的例外情形。例如，对于垄断行为和价格违法行为，由于其成本难以量化且社会危害性较大，通常按全部收入计算违法所得，不扣除支出。
   • 此外，对于故意伪造、隐藏、删除证据材料等主观恶性情形的，也属于按全部收入计算违法所得的情形。

三、违法所得的认定规则

1. 构成要素细化：

   • 违法所得的成立需具备两个要素：违法性和因果关系。即违法所得必须来源于违法行为，且这种收入与违法行为之间存在直接的、客观的、常识认可的因果关系。

2. 分领域认定：

   • 不同领域的违法所得认定规则可能有所不同。例如，在工商领域，通常以“扣除成本说”为原则；在食品安全领域，则可能采用“全额说”，即按全部销售收入计算违法所得，不扣除成本（但存在例外情形）。

3. 特殊情形处理：

   • 对于因系列主客观因素导致违法所得难以计算、价格违法行为中多收价款无法确定以及法律法规法律责任中未明确设定没收违法所得的行政处罚内容且无法合理计算等情形，市场监管部门可以不予没收违法所得，而是将上述情形作为确定罚款数额的考量要素。

四、实际案例应用

在实际案例中，市场监管局会根据上述原则和规则，结合具体案情，对违法所得进行认定。例如，对于一起违法销售商品的案件，市场监管局会首先确定销售收入，然后扣除购进价款等直接成本，最终计算出违法所得。

五、法律建议

对于市场监管领域的经营者来说，了解并掌握违法所得的认定原则和规则至关重要。这不仅有助于避免违法行为的发生，还能在面临行政处罚时，更准确地理解并接受处罚决定。同时，如果对于违法所得的认定存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以维护自己的合法权益。

综上所述，市场监管局行政处罚案件违法所得的认定是一个复杂而细致的过程，需要综合考虑多个因素和细节。希望以上解答能对您有所帮助。如果您有进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。