针对您提出的问题“被告人认罪但事实证据不足怎么办”，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确一点，即使被告人承认了自己的罪行，但如果证据不足，那么法律程序仍然需要遵循“以事实为依据，以法律为准绳”的原则。接下来，我将从几个不同的诉讼阶段来解答您的问题。
一、侦查阶段
在侦查阶段，如果公安机关或检察机关发现证据不足，无法充分证明被告人的罪行，那么他们可能会直接撤销案件，或者继续进行侦查以收集更多证据。
二、审查起诉阶段
当案件进入检察院的审查起诉阶段时，如果检察院认为证据不足，他们可能会建议公安机关撤回案件，或者直接作出不起诉的决定。这意味着，即使被告人认罪，但如果检察院认为证据不足以支持起诉，他们仍然会依法作出不起诉的决定。
三、审判阶段
如果案件已经进入了法院的审判阶段，而法院在审理过程中发现证据不足，无法认定被告人的罪行，那么法院会依法作出无罪判决。这是法院根据“疑罪从无”原则作出的决定，即在没有足够证据证明被告人有罪的情况下，法院会倾向于保护被告人的合法权益，作出无罪判决。
四、证据不足时的建议
继续侦查或补充证据：如果案件处于侦查或审查起诉阶段，且证据不足，那么相关机关可以继续进行侦查或要求补充证据，以确保案件的公正处理。
寻求法律援助：被告人或其家属可以寻求专业的法律援助，咨询律师的意见，了解案件的法律程序和可能的结果。
保持冷静与配合：即使面临证据不足的情况，被告人也应保持冷静，积极配合相关机关的调查工作，同时保护自己的合法权益。
综上所述，被告人认罪但事实证据不足时，法律程序会根据不同阶段的实际情况作出相应的处理。无论是撤销案件、不起诉还是无罪判决，都是基于法律原则和案件事实作出的决定。希望这个解答能够对您有所帮助。