关于结算单需要双方盖章还是单方盖章的问题，这主要取决于具体的合同约定以及法律法规的要求。

从法律的角度来看，根据《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民事诉讼法>的解释》的相关规定，单位向人民法院提出的证明材料，应当由单位负责人及制作证明材料的人员签名或者盖章，并加盖单位印章。这一规定虽然针对的是单位向人民法院提出的证明材料，但也可以类推适用于结算单等商业文件。因此，为了确保结算单的法律效力，最好是由双方盖章，并且由各自的法定代表人或其授权的代理人签字确认。

在实际操作中，如果结算单仅由单方盖章，而没有对方的确认，那么这份结算单在法律效力上可能会存在瑕疵。如果对方对此提出异议，可能会引发纠纷。因此，为了避免不必要的法律风险，建议在签订结算单时，双方都应该认真核对内容，并在确认无误后由各自的法定代表人或其授权的代理人签字盖章。

综上所述，为了确保结算单的法律效力和避免潜在的纠纷，建议结算单由双方盖章，并由各自的法定代表人或其授权的代理人签字确认。这样做不仅符合法律法规的要求，也能更好地保护双方的合法权益。