公司打卡迟到扣钱是否合法，需根据具体情况判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 合法情况：

   • 若公司依法制定了关于迟到扣钱的规章制度，且该规章制度内容合法、合理，并已向员工公示，则公司依据该规章制度对迟到员工进行合理扣钱是合法的。这是公司行使用工自主权的体现，不违反法律。
   • 法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第四条、《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第五十条。

2. 不合法情况：

   • 若公司未依法制定关于迟到扣钱的规章制度，或制定了但未进行公开公示并告知员工，则对迟到员工的扣钱行为可能不合法。
   • 若扣罚金额过高，导致劳动者工资明显不合理减少，甚至低于当地最低工资标准，或扣除比例显失公平，则公司的扣钱行为也可能违反法律。
   • 法律依据：《中华人民共和国劳动法》第五十条、《中华人民共和国劳动合同法》第三十条、《劳动保障监察条例》第二十六条。

3. 特殊情况：

   • 若员工因不可抗力等合理原因导致迟到，公司仍扣工资则不合理，应考虑实际情况予以豁免或减轻处罚。

综上所述，公司打卡迟到扣钱的合法性需综合考虑规章制度的制定和执行是否符合法律规定、扣罚措施是否合理等因素。若劳动者认为用人单位的迟到扣工资规定不合理或存在违法情况，可通过协商、申请调解、仲裁或提起诉讼等方式维护自己的合法权益。如有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。