针对您提出的“合同终止协议约定未付清款项，原合同不终止”的问题，以下是我的详细解答：

结论：合同能否终止需根据具体情况判断，主要依据合同中的约定以及未付清款项的性质和后果。

1. 合同约定优先：

   • 如果合同明确约定了付款方未付清款项时，另一方是否有权终止合同，那么应严格按照合同约定执行。
   • 若合同约定在未付清款项时原合同不终止，则即使存在未付款项，合同依然有效，双方需继续履行。

2. 未付清款项的性质：

   • 如果未付清款项构成根本违约，即该未付款项导致合同目的无法实现，那么守约方有权依法解除合同。
   • 若只是部分款项未付，且未达到根本违约的程度，如已交付货物仅尾款未付，那么另一方不能随意终止合同，而应要求对方继续履行付款义务并承担违约责任。

3. 法律后果：

   • 在合同未明确约定或约定不明确的情况下，判断未付清款项是否构成根本违约是关键。
   • 若构成根本违约，守约方除有权解除合同外，还可以要求违约方承担违约责任，包括赔偿损失等。
   • 若不构成根本违约，则合同继续有效，双方应继续履行，同时违约方需承担相应的违约责任。

综上所述，合同终止与否需根据合同中的具体约定以及未付清款项的性质和后果来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。