营运车辆发生交通事故致人死亡且负主责，一般情况下是难以避免被起诉的。但是，在一些特殊情况下，如肇事者有主动投案的情节，以及积极赔偿被害人家属的损失并且获得了他们的谅解等，有可能不被起诉。具体是否免于起诉，需要综合案件的具体状况，由司法机关依照法律来进行判断。

以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条的规定，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役；交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。

2. 不起诉的特定条件：

   • 法定不起诉：若事故情节显著轻微，危害不大，且难以完全归责于犯罪嫌疑人，或存在其他如犯罪已过追诉时效、经特赦令免除刑罚等法定情形，可能适用《刑事诉讼法》第十六条的法定不起诉条款。
   • 酌定不起诉：若犯罪嫌疑人犯罪情节轻微，有自首、立功表现，积极赔偿被害人家属并取得谅解，认罪悔罪态度良好等，检察院可作出酌定不起诉决定。
   • 证据不足不起诉：若案件经过二次补充侦查仍证据不足，不符合起诉条件，检察院应作出证据不足不起诉的决定。

3. 实际操作中的考量因素：

   • 在司法实践中，是否起诉会综合考虑多种因素，包括犯罪情节、悔罪表现、赔偿情况以及社会影响等。
   • 若肇事者能够主动投案、积极赔偿被害人家属并取得谅解，这将在很大程度上影响其是否会被起诉以及最终的量刑结果。

4. 建议与指导：

   • 如果你作为肇事者面临这样的情况，建议立即报警并全力配合相关部门的调查工作，以明确事故责任和事实。
   • 在条件允许的情况下，应积极与被害人家属协商赔偿事宜，并努力获得他们的谅解。
   • 同时，咨询专业律师（如我）以获取针对性的法律建议和指导，确保自身权益得到妥善保护。

综上所述，营运车辆发生交通事故致人死亡且负主责时，一般情况下是难以避免被起诉的。但是，在特定条件下存在不起诉的可能性。因此，建议肇事者在事故发生后积极应对，依法处理后续事宜，并咨询专业律师以获取法律帮助。