针对您提出的问题“招标方没有把投标文件的条款写进合同中但是项目已经结束了怎么办”，首先我们需要明确一点：尽管项目已经结束，但合同仍然是双方权利义务的依据。如果招标方在合同中未包含投标文件的某些关键条款，这确实可能引发一些法律上的争议或风险。以下是我对此问题的详细分析：

1. 合同效力与条款缺失的影响：

   • 首先，我们要确认合同的效力。如果合同已经双方签字盖章并实际履行，那么它通常是有法律效力的。
   • 条款的缺失可能会影响双方对合同内容的理解和执行。如果缺失的条款对双方权利义务有重大影响，那么可能会引发争议。

2. 分析缺失条款的性质：

   • 如果缺失的条款是投标文件中的核心条款，比如价格、质量、工期等，那么这些条款的缺失可能会影响到合同的根本目的。
   • 如果缺失的条款是辅助性的或程序性的，比如投标保证金的处理、争议解决方式等，那么这些条款的缺失可能不会直接影响合同的履行，但可能会在争议解决时产生麻烦。

3. 法律建议：

   • 协商补充：首先，建议双方通过协商来补充缺失的条款。如果双方能够达成一致，那么可以签订补充协议来明确双方的权利义务。
   • 依据习惯或惯例：如果缺失的条款在行业内或双方之前有明确的习惯或惯例，那么可以依据这些习惯或惯例来执行。
   • 法律救济：如果协商不成，且缺失的条款对一方造成了重大损失，那么受损方可以考虑通过法律途径来寻求救济。比如，可以起诉要求对方承担违约责任或赔偿损失。

4. 后续行动：

   • 在采取任何法律行动之前，建议双方先进行沟通，尝试通过友好协商来解决问题。
   • 如果需要法律帮助，您可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供进一步的法律建议。

综上所述，尽管项目已经结束，但合同中的条款缺失仍然需要得到妥善处理。双方应通过协商、依据习惯或惯例或采取法律救济等方式来明确双方的权利义务，以避免可能的争议和风险。