对于重大危险源未登记建档的处罚，根据《中华人民共和国安全生产法》的相关规定，具体处罚措施如下：

首先，相关监管部门会责令生产经营单位限期改正这一违规行为。在这一阶段，生产经营单位有机会进行整改，以避免更严重的处罚。

如果生产经营单位在规定的期限内未能完成整改，即逾期未改正，那么将面临更严厉的处罚。具体来说，监管部门会责令该单位停产停业整顿，并处以十万元以上二十万元以下的罚款。此外，对于该单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员，还会处以二万元以上五万元以下的罚款。

需要注意的是，如果这一行为构成犯罪，那么还将依照刑法的有关规定追究相关人员的刑事责任。

综上所述，对于重大危险源未登记建档的处罚是相当严厉的，不仅涉及到经济处罚，还可能影响到生产经营单位的正常运营以及相关人员的职业生涯。因此，建议各生产经营单位务必重视重大危险源的登记建档工作，确保安全生产。