关于股东不同意变更法人如何处理的问题，首先我们要明确的是，法定代表人的变更需要遵循公司章程的规定，并通常需要通过股东会或董事会的决议。以下是我根据相关法律法规和公司实务给出的详细解答：

1. 查看公司章程：

   • 首先，应查看公司章程中关于法人变更的具体规定，特别是是否需要一定比例以上的股东同意。如果章程中有明确规定，那么就必须按照章程来执行。

2. 股东会决议：

   • 在一般情况下，变更法定代表人需要股东会作出有效决议。对于有限责任公司，通常需要代表三分之二以上表决权的股东通过。如果未达到此比例，那么变更程序可能存在问题。

3. 不同意股东的权益：

   • 如果部分股东不同意变更，他们应审视变更理由是否合理合法。如果存在滥用职权、损害公司或股东利益等情况，不同意的股东可以通过法律途径维权，比如提起诉讼要求停止侵权、恢复原状等。
   • 同时，如果变更程序合法合规且符合公司利益，不同意的股东也应权衡利弊，尽量通过协商解决，以防止影响公司的正常运营。

4. 协商与调解：

   • 在股东之间出现分歧时，协商和调解是解决问题的有效途径。可以通过召开股东会议，让各方充分表达意见，寻求共识。
   • 如果协商不成，也可以考虑邀请第三方调解机构或专业律师进行调解，以达成和解。

5. 法律途径：

   • 如果协商和调解均无法解决问题，不同意的股东可以依法向法院提起诉讼，要求确认变更无效或维护自己的合法权益。

综上所述，处理股东不同意变更法人的问题，需要综合考虑公司章程、股东会决议、不同意股东的权益以及协商与调解等多种因素。如果问题复杂或涉及法律纠纷，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。