结论前置：
三间同一通道祖屋拆迁后不让通行，这种行为是否合法取决于具体的法律事实和法律规定。如果通道是公共通道或者属于拆迁协议中应保留的通行权利，那么不让通行是不合法的。如果通道并不属于公共通道，且拆迁协议中并未明确保留通行权利，那么不让通行可能并不违法。
详细分析：
公共通道的情况：
- 如果这三间祖屋原本共用一个通道，且该通道在法律上被认定为公共通道，那么拆迁后，相关方应确保该通道的畅通，不得无故阻止他人通行。
- 若通道被阻塞，受影响的居民有权要求恢复通行，并可通过法律途径维护自己的合法权益。
拆迁协议中的约定：
- 拆迁时，通常会签订拆迁协议，其中应明确各方的权利和义务，包括通行权利。
- 如果拆迁协议中明确保留了通行权利，那么拆迁后不让通行就违反了协议约定，是不合法的。
- 此时，受影响方可以依据拆迁协议向相关部门或法院提起诉讼，要求恢复通行权利。
非公共通道且无协议约定的情况：
- 如果通道并非公共通道，且拆迁协议中并未明确保留通行权利，那么拆迁后不让通行可能并不违法。
- 在这种情况下，受影响方需要与其他相关方进行协商，寻求解决方案，如重新开辟通道或达成其他协议。
法律建议：
- 首先，建议受影响方查看拆迁协议，明确其中是否包含通行权利的约定。
- 如果协议中未明确，但通道确实是公共通道或历史上形成的通行路径，可以收集相关证据，如历史照片、邻里证言等，以证明通行权利的存在。
- 在与拆迁方或其他相关方协商无果的情况下，可以寻求法律援助或向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
总结：
三间同一通道祖屋拆迁后不让通行是否合法，需要根据具体情况来判断。如果通道是公共通道或拆迁协议中保留了通行权利，那么不让通行是不合法的。如果并非公共通道且协议中未明确保留通行权利，那么需要双方协商解决。在任何情况下，受影响方都有权寻求法律援助和提起诉讼来维护自己的权益。