捡到手机没有及时归还而是扔掉了，如果对方报案，是有可能留下案底的。具体分析如下：

1. 法律性质：

   • 捡到手机不归还，而是将其扔掉，这可能构成侵占他人财物的行为。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，侵占他人财物数额较大的，可能构成侵占罪，需要承担刑事责任。

2. 报案与案底：

   • 如果对方报案，公安机关会进行调查。在调查过程中，如果发现你有侵占他人财物的行为，并且数额较大，公安机关可能会对你进行立案处理。
   • 一旦立案，你的个人信息和案件情况就会被记录在公安机关的系统中，这通常所说的“留案底”。

3. 可能后果：

   • 如果构成侵占罪，你可能需要承担刑事责任，包括可能被判处刑罚、罚金等。
   • 即使不构成犯罪，你的行为也可能被视为不道德或违法的，这可能会对你的社会声誉和信用记录产生负面影响。

4. 建议：

   • 如果你捡到了手机，应该及时归还给失主，或者交给公安机关等有关部门处理。
   • 如果你已经扔掉了手机，并且对方已经报案，你应该积极配合公安机关的调查，如实说明情况。

综上所述，捡到手机没有及时归还而是扔掉，如果对方报案，是有可能留下案底的。因此，建议你在日常生活中要遵守法律法规，尊重他人的财产权，避免类似情况的发生。