改变房屋主体结构后，即使恢复原样，也可能面临罚款。

首先，从法律角度来看，擅自改变房屋的主体结构是违法的，因为这可能影响到房屋的安全性和稳定性，进而危及到居住者的生命财产安全。一旦这种违法行为被发现，相关部门会责令立即改正，并恢复原状。

关于“恢复原状”的标准，它并不仅仅意味着将房屋外观恢复到改变前的样子，更重要的是要恢复房屋原有的功能性和安全性。这包括修复可能因改变结构而受损的承重墙、梁柱等关键部位，确保房屋的整体结构稳定。

即使房屋主体结构在改变后又被恢复原样，但由于这种改变本身已经构成了违法行为，因此恢复原状并不能免除违法者应承担的法律责任。根据相关规定，违法者可能会面临一定数额的罚款，以作为对其违法行为的惩戒。

综上所述，改变房屋主体结构后，即使恢复原样，也可能因为之前的违法行为而面临罚款。因此，建议在进行任何房屋改造前，务必咨询相关部门或专业人士，确保改造行为合法合规，避免不必要的法律风险。如果你有任何关于房产问题的疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。