在非吸（非法吸收公众存款）案件中，对于业务员工资提成流水不清的情况，具体金额的认定确实是一个复杂且关键的问题。以下是我根据多领域法律实务经验，给出的详细解答：

首先，会依据现有证据进行初步认定。

1. 审查已有流水记录：尽管流水不清，但侦查机关和司法机关仍会尽力审查已有的银行流水、财务记录、工资单等，以从中提取出与业务员提成相关的线索。
2. 询问相关证人：包括业务员本人、公司财务、其他知情人等，以获取关于提成比例、计算方式、发放时间等方面的口供和证言。

其次，若初步认定存在困难，会采取进一步措施。

1. 司法审计：可能会聘请专业的司法审计机构，对涉案公司的财务状况进行全面审计，以查清业务员的提成情况。
2. 推定认定：在确实无法直接查清具体金额的情况下，司法机关可能会根据其他相关证据和情况，进行推定认定。例如，根据同行业的平均提成比例、业务员的业绩情况等因素，来合理推定其提成金额。

最后，综合考虑多种因素进行最终认定。

在认定过程中，司法机关会综合考虑各种因素，如业务员的职位、职责、工作表现、提成惯例等，以确保认定的金额既符合实际情况，又体现公平公正。

总结来说，非吸案件中业务员工资提成流水不清时，司法机关会依据现有证据进行初步认定，并在必要时采取进一步措施如司法审计或推定认定。在整个过程中，都会综合考虑多种因素，以确保最终认定的金额准确无误。如果你或你身边的人面临此类问题，建议尽早咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。