针对您提出的问题，即被告写了现金借条，但原告将款项转给了第三方，而第三方又向原告出具了借据，法院会如何判决，以下是我的详细分析：
结论前置
在此类案件中，法院的判决将主要取决于以下几个关键因素的综合考量：借条的真实性、款项交付的事实、第三方借据的性质，以及当事人之间的法律关系。若原告能充分证明借条的真实性、款项已实际交付给被告（或通过被告指示交付给第三方），且第三方借据不影响原、被告之间的借贷关系，则法院很可能判决被告承担还款责任。
详细分析
借条的真实性：
- 法院首先会审查借条是否由被告亲笔书写并签名，确保借条的真实性。
- 借条上的内容应清晰明确，包括借款金额、借款时间、还款期限等关键信息。
款项交付的事实：
- 原告需提供证据证明款项已实际交付。虽然款项是转给了第三方，但如果原告能证明这是受被告指示或被告认可的行为，则视为款项已交付给被告。
- 可能的证据包括转账记录、被告的指示证明（如短信、邮件等）、第三方的确认等。
第三方借据的性质：
- 第三方向原告出具的借据，并不必然影响原、被告之间的借贷关系。法院会审查该借据是否构成新的借贷关系，或是否只是款项流转的凭证。
- 如果第三方借据仅证明款项流转，而不构成新的借贷关系，则不影响原、被告之间的借贷纠纷。
当事人之间的法律关系：
- 法院会审查原、被告及第三方之间的法律关系，以确定款项的性质和流向。
- 如果被告能证明款项是原告与第三方之间的交易，且自己并未实际收到或使用款项，则可能减轻或免除其还款责任。
综合判断：
- 法院将综合上述因素，判断原、被告之间是否存在真实的借贷关系，以及被告是否应承担还款责任。
- 如果原告能充分证明其主张，且被告无法提供有效反驳，则法院很可能判决被告承担还款责任。
风险防范建议
对于此类情况，建议当事人在借款时务必明确款项的交付方式和对象，确保借贷关系的清晰和明确。同时，保留好所有相关的证据和文件，以便在发生纠纷时能够充分证明自己的主张。
综上所述，法院的判决将取决于多个因素的综合考量。如果您面临此类问题，建议尽快咨询专业律师，以便根据您的具体情况制定合适的应对策略。