针对“二级综合医院取消中医科是否合理合法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一、国家政策法规层面

根据《中华人民共和国中医药法》的相关规定，政府举办的综合医院应当设置中医药科室。这一规定明确了综合医院在科室设置上应当包含中医科，以体现国家对中医药事业的重视和支持。同时，该法也强调了中医药在我国卫生健康事业中的显著优势和重要作用，因此，从政策法规的角度来看，二级综合医院取消中医科并不符合国家的相关规定。

二、实际执行与普遍情况

从实际执行情况来看，超九成二级以上公立综合医院都开设了中医临床科室。这一数据不仅反映了国家对中医药政策的落实力度，也体现了中医科在综合医院中的重要地位。中医科作为综合医院的一部分，与西医科室相互补充、协调发展，共同为患者提供全面、优质的医疗服务。因此，从普遍情况来看，二级综合医院取消中医科并不符合当前医疗服务的实际需求和发展趋势。

三、合理性与合法性的综合考量

1. 合理性：中医科在综合医院中发挥着不可替代的作用，尤其是在中西医结合治疗、慢性病管理、康复理疗等方面具有独特优势。取消中医科可能会削弱医院的整体服务能力，影响患者的治疗效果和康复进程。因此，从合理性的角度来看，二级综合医院取消中医科并不合理。

2. 合法性：如前所述，《中华人民共和国中医药法》明确规定政府举办的综合医院应当设置中医药科室。因此，如果二级综合医院擅自取消中医科，将违反国家法律法规，面临相应的法律后果。从合法性的角度来看，二级综合医院取消中医科是不合法的。

综上所述，二级综合医院取消中医科既不合理也不合法。医院应当严格遵守国家法律法规，确保科室设置的完整性和合理性，以满足患者的多元化医疗需求。同时，政府和相关部门也应加强对医院的监管和指导，推动中医药事业的健康发展。