针对您提出的“工厂运营没办证怎么处罚”的问题，以下是根据相关法律法规为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，工厂运营未办理相关证照是违法的，根据《无证无照经营查处办法》的相关规定，将受到相应的处罚。
处罚依据
- 《无证无照经营查处办法》第十三条：从事无照经营的，由工商行政管理部门依照相关法律、行政法规的规定予以处罚。法律、行政法规对无照经营的处罚没有明确规定的，由工商行政管理部门责令停止违法行为，没收违法所得，并处1万元以下的罚款。
处罚流程
- 立案责任：相关执法部门在发现涉嫌无照经营的违法行为后，会进行审查，并决定是否立案。
- 调查责任：对立案的案件，执法部门会指定专人负责，及时组织调查取证，包括亲临现场调查、收集证据等。调查过程中，执法人员不得少于两人，且需出示执法证件。
- 审查责任：案件调查终结后，执法部门会对案件的违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度、当事人陈述和申辩理由等方面进行审查，并提出处理意见。
- 告知责任：在作出行政处罚决定前，执法部门会制作《行政处罚告知书》送达当事人，告知其拟作出行政处罚的事实、理由、依据及结果，并告知当事人享有陈述、申辩的权利。
- 决定责任：执法部门会制作《行政处罚决定书》，并在七日内送达当事人，同时向当事人当面宣读。
- 执行责任：执法部门会监督当事人在决定的期限内履行生效的行政处罚决定。
特殊情况说明
- 若工厂运营未办理证照，但属于在县级以上地方人民政府指定的场所和时间销售农副产品、日常生活用品，或者个人利用自己的技能从事依法无须取得许可的便民劳务活动等特定情况，则不属于无证无照经营。
- 对于具备办理证照的法定条件且有继续经营意愿的经营者，执法部门会督促、引导其依法办理相应证照。
举报与信用记录
- 任何单位或个人有权向查处部门举报无证无照经营行为。
- 查处部门会将无证无照经营行为记入信用记录，并依法进行公示。
综上所述，工厂运营未办理相关证照将面临工商行政管理部门的处罚，包括责令停止违法行为、没收违法所得及罚款等。因此，建议工厂在运营前务必办理好所有必要的证照，以避免不必要的法律风险和经济损失。