第三方机构代理农村个人养老金激活是否合法，需根据具体情况判断。

一. 代理行为的合法性

1. 代理关系的建立：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，代理人在代理权限内，以被代理人的名义实施的民事法律行为，对被代理人发生效力。因此，如果农村个人明确授权第三方机构代理其养老金激活事宜，且该机构在授权范围内行事，则此代理行为是合法的。

2. 代理权限的明确：关键在于代理权限是否明确且合法。如果代理权限模糊或超越法定范围，那么代理行为可能构成无权代理或滥用代理权，从而引发法律纠纷。

二. 养老金激活的特殊性

1. 个人养老金的性质：农村个人养老金是农民的重要社会保障，其管理和使用受到法律的严格保护。因此，任何涉及养老金的操作，包括激活，都必须严格遵守相关法律法规。

2. 激活过程的合规性：养老金的激活通常需要本人持有效身份证件到指定机构办理。如果第三方机构以非法手段或欺诈方式代理激活，将构成违法行为。

三. 结论与建议

• 结论：第三方机构代理农村个人养老金激活的合法性取决于代理关系的建立是否合法、代理权限是否明确且合法，以及激活过程是否合规。

• 建议：农村个人在考虑是否委托第三方机构代理养老金激活时，应谨慎选择，确保代理机构具有合法资质和良好信誉。同时，应明确代理权限，避免权限滥用。如有疑虑，建议直接咨询当地社保部门或专业律师。

综上所述，第三方机构代理农村个人养老金激活的合法性并非一概而论，而是需要根据具体情况进行判断。如有进一步需要，您可以继续咨询我。