被征用口粮地的农户在领取征地补偿款后，与基于土地批复违法办理的国有土地使用权证不具有利害关系。以下是对此结论的详细分析：
一. 领取征地补偿款后的法律效果
- 丧失土地使用权：根据相关法律法规及实践，当农户领取征地补偿款后，即视为其已经同意土地被征用，并因此丧失了对该土地的使用权。在此情况下，农户与后续的土地使用权证办理等事宜不再具有直接的利害关系。
- 法律关系的转变：领取补偿款前，农户作为土地的使用权人，与土地批复、土地使用权证的办理等具有利害关系。但领取补偿款后，这一法律关系即发生转变，农户不再享有土地的相关权益。
二. 土地批复违法办理的后果
- 对原土地使用权人的影响：虽然土地批复的违法办理可能涉及行政违法或法律责任，但这主要针对的是办理批复的行政机关或相关人员，而非已经领取补偿款并丧失土地使用权的农户。
- 利害关系的判断：利害关系通常指某一法律事实或行为对特定主体的权益产生的直接影响。在此情况下，由于农户已经领取补偿款并丧失土地使用权，因此土地批复的违法办理对其不再具有直接的利害关系。
三. 结论的法律依据
- 《中华人民共和国行政复议法实施条例》相关规定：根据该条例，申请人与具体行政行为有利害关系是行政复议机关受理行政复议申请的法定条件之一。但在此案例中，农户在领取征地补偿款后，已经丧失了与原集体土地的合法使用权，因此与后续的土地批复、土地使用权证办理等不再具有利害关系。
综上所述，被征用口粮地的农户在领取征地补偿款后，与基于土地批复违法办理的国有土地使用权证不具有利害关系。这一结论符合相关法律法规的规定，也符合实践中的操作惯例。如有进一步需要，您可以继续咨询我。