集体土地所有权证被侵犯，确实违反了相关法律规定，但需注意《物权法》已失效，相关内容已纳入《民法典》。以下从不同角度为您详细分析：

1. 法律背景与规定：

   • 集体土地所有权证是确认集体土地所有权的法律凭证，受到法律严格保护。根据《民法典》第二百六十二条：“对于集体所有的土地和森林、山岭、草原、荒地、滩涂等，依照下列规定行使所有权：……（二）分别属于村内两个以上农民集体所有的，由村内各该农村集体经济组织或者村民小组依法代表集体行使所有权；……”。这表明，集体土地所有权是受到法律明确保护的权益。
   • 当集体土地所有权证被侵犯时，即意味着集体土地所有权受到了侵害，这违反了《民法典》中关于物权保护的相关规定。

2. 侵权行为的法律后果：

   • 如果集体土地所有权证被侵犯，集体组织有权要求侵权人停止侵害、恢复原状、赔偿损失等。这是基于《民法典》中关于物权保护的基本原则，即物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。
   • 在具体案件中，法院会根据侵权行为的性质、情节、后果等因素，综合判断侵权人的法律责任，并作出相应的判决。

3. 实际操作与建议：

   • 一旦发现集体土地所有权证被侵犯，集体组织应立即收集证据，包括但不限于土地权属证明、侵权行为照片、视频等，以证明侵权事实的存在。
   • 随后，集体组织可以与侵权人进行协商，尝试通过和解的方式解决纠纷。如果协商无果，可以向当地土地管理部门或相关行政机关投诉，请求其介入调查并处理。
   • 若行政途径无法解决问题，集体组织还可以考虑通过法律途径解决，即向法院提起诉讼，要求侵权人承担法律责任。

总结与建议：集体土地所有权证被侵犯是违反《民法典》中关于物权保护规定的行为。集体组织应积极采取措施维护自己的合法权益，包括收集证据、协商和解、投诉行政机关或提起诉讼等。如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。