当单位收到员工的劳动仲裁申请时，应当按照以下流程妥善处理：

1. 仔细研读仲裁申请书：

   • 首先要详细阅读员工提交的仲裁申请书，明确员工的诉求、依据以及所附的证据材料。
   • 梳理相关事实和证据，对员工的诉求进行初步评估。

2. 准备答辩材料与证据：

   • 组织内部相关部门和人员，针对员工的诉求进行全面评估。
   • 收集和整理单位自身的证据，如劳动合同、考勤记录、工资发放凭证、规章制度等，以支持单位的观点和反驳员工的主张。
   • 清晰确定答辩思路，针对员工的诉求，备好答辩意见，明确单位的立场和理由。

3. 提交答辩书：

   • 在规定的期限内，按照劳动仲裁的要求提交答辩书。
   • 答辩书应明确表达单位的态度和理由，并附上相关证据。
   • 确保答辩书的内容详尽、逻辑清晰，有力地回应员工的诉求。

4. 参与仲裁庭审：

   • 按时参加庭审，积极配合仲裁庭的工作。
   • 如实陈述事实，遵守仲裁程序和规则。
   • 在庭审过程中，积极表达单位的观点，并对员工的陈述进行仔细审核和反驳。

5. 等待裁决结果并履行义务：

   • 庭审结束后，耐心等待仲裁庭的裁决结果。
   • 如果对裁决结果不服，可在规定的期限内提起上诉或申请撤销裁决。
   • 如果裁决结果生效，单位应认真履行相应的义务，如支付赔偿金、恢复劳动关系等。

此外，单位在收到劳动仲裁申请后，还应注意以下几点：

• 保持冷静与理性：避免情绪化处理问题，以客观、理性的态度应对员工的仲裁申请。
• 加强内部沟通与管理：针对员工的诉求和仲裁申请，反思单位在劳动管理方面的不足，加强内部沟通与管理，避免类似纠纷的再次发生。
• 寻求专业法律支持：如果单位在处理劳动仲裁过程中遇到复杂或棘手的问题，可以寻求专业律师的法律支持，以确保单位的合法权益得到妥善维护。

希望以上流程能够帮助单位妥善处理员工的劳动仲裁申请。如果单位在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。