纪检罚款完后，过了3年并不影响案件的结案。结案与否主要取决于案件的具体情况和相关法律规定，而非仅仅基于时间因素。以下是对此问题的详细分析：

1. 案件处理流程：纪检案件的处理通常需要经过调查、审查、决定等多个阶段。在每个阶段，都会根据案件的事实、证据以及相关法律法规进行相应的处理。罚款只是其中的一种处理方式，它并不直接决定案件是否结案。

2. 结案条件：一般来说，纪检案件结案需要满足一定的条件，如案件事实清楚、证据确凿、处理决定已经作出并送达当事人、当事人未提出异议或异议已得到妥善处理等。这些条件与罚款是否缴纳以及缴纳后的时间长度无直接关联。

3. 时间因素：虽然时间在某些法律程序中可能是一个考虑因素，但并非决定性因素。在纪检案件中，即使罚款已经缴纳多年，如果案件存在其他未解决的问题或当事人提出新的异议，案件仍然可能重新被审查或处理。

4. 法律规定：具体的结案条件和程序可能因地区、机构或案件类型的不同而有所差异。因此，在判断案件是否结案时，应参考相关的法律法规和具体规定。

综上所述，纪检罚款完后过了3年，并不影响案件的结案。案件的结案与否主要取决于案件的具体情况和相关法律规定。如果您有具体的纪检案件问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。