针对你提出的“没有手续的房屋村委会说不合法怎么办”的问题，首先我们要明确一点：没有合法手续的房屋，确实可能存在法律风险，包括被认定为违法建筑。但具体处理方式，还需根据具体情况来分析。以下是我给出的详细建议：

1. 核实房屋手续情况：

   • 首先，你需要核实房屋确实缺少哪些手续。这可能包括土地使用权证、建设规划许可证、施工许可证等。了解缺失的具体手续，有助于你后续采取针对性的补救措施。

2. 咨询当地政策：

   • 不同地区对于房屋手续的要求可能有所不同。建议你咨询当地住建、规划等相关部门，了解具体的政策要求和补办手续的流程。

3. 与村委会沟通：

   • 村委会作为基层管理组织，对于当地的情况较为熟悉。你可以与村委会进行深入沟通，了解他们认定房屋不合法的具体依据，以及是否有可能通过补办手续等方式使房屋合法化。

4. 补办相关手续：

   • 如果房屋确实缺少必要的手续，你应尽快按照当地政策要求补办。这可能包括提交申请、提供相关资料、缴纳费用等步骤。补办手续后，房屋的法律地位将得到明确，从而降低法律风险。

5. 寻求法律援助：

   • 如果在补办手续过程中遇到困难，或者你对当地政策不够了解，可以寻求专业律师的法律援助。律师将根据你的具体情况，提供针对性的法律建议和服务。

6. 考虑房屋的实际用途和价值：

   • 在处理没有手续的房屋时，你还需要考虑房屋的实际用途和价值。如果房屋具有重要的使用价值或经济价值，且补办手续成本较高，你可能需要权衡利弊，做出合理的决策。

综上所述，面对没有手续的房屋被村委会认定不合法的情况，你应首先核实手续情况，咨询当地政策，与村委会沟通，并尽快补办相关手续。如果遇到困难或需要更专业的法律建议，可以随时向我咨询。