农村建房意外伤害险和意外险可以一起到保险公司申请赔偿，但赔偿总额不应超过实际发生的医疗费用。以下是对此问题的详细分析：

一. 保险赔偿的基本原则

保险赔偿实行的是补偿性原则，即被保险人因保险事故所遭受的损失，应得到充分的补偿，但赔偿金额不应超过实际损失。这一原则在《中华人民共和国保险法》中有明确体现，虽然具体条款未直接规定两种保险的赔偿顺序和限额，但根据保险法的基本原则，可以推断出赔偿总额不应超过实际损失。

二. 农村建房意外伤害险与意外险的赔偿关系

1. 保险责任不同：

   • 农村建房意外伤害险：主要针对在农村建房过程中因意外事故导致的伤害进行赔偿，包括医疗费用、残疾赔偿、死亡赔偿等。
   • 意外险：通常覆盖更广泛的意外事故，包括但不限于建房过程中的意外，还包括日常生活中的其他意外事故。

2. 赔偿的互补性：

   • 由于两种保险的保险责任不同，且均遵循补偿性原则，因此在实际操作中，被保险人可以同时向两种保险的承保公司申请赔偿。
   • 但需要注意的是，赔偿总额不应超过实际发生的医疗费用。如果一种保险已经赔偿了部分费用，另一种保险将只赔偿剩余未赔偿的合理部分。

三. 赔偿申请流程

1. 先申请新农合（如适用）：

   • 如果被保险人同时参加了新型农村合作医疗（新农合），应先向新农合申请报销医疗费用。
   • 新农合报销后，被保险人可凭借相关凭证和单据，向意外险或农村建房意外伤害险的承保公司申请赔偿剩余未报销的医疗费用。

2. 再申请意外险或农村建房意外伤害险：

   • 在获得新农合报销后，被保险人可按照意外险或农村建房意外伤害险的保险条款，向承保公司提交赔偿申请。
   • 承保公司将根据保险条款和实际情况，对赔偿申请进行审核和处理。

四. 我的观点

农村建房意外伤害险和意外险在保险责任上存在差异，但均遵循补偿性原则。因此，被保险人可以同时向两种保险的承保公司申请赔偿，但赔偿总额不应超过实际发生的医疗费用。在实际操作中，建议被保险人先向新农合申请报销医疗费用，再向意外险或农村建房意外伤害险的承保公司申请赔偿剩余部分。如有进一步需要，您可以继续咨询我。