在商事仲裁中，如果被申请人主张赔付违约金过高，确实应当提供证据证明申请人的主张。以下是对这一问题的详细分析：
举证责任的原则：
- 在法律实务中，主张违约金过高的一方（即被申请人）需要承担举证责任。这意味着，被申请人需要提供充分的证据来证明约定的违约金明显过高，超出了实际损失的合理范围。
举证的内容：
- 被申请人需要提供的证据应能证明违约金数额与实际损失之间的不合理性。例如，可以提交市场同类合同的违约金标准、实际损失的计算依据、合同履行过程中的相关证据等，以证明约定的违约金过高。
未能举证的风险：
- 如果被申请人未能有效举证，可能会面临违约金被仲裁庭认定为合理的风险。在这种情况下，被申请人将需要按照合同约定的违约金数额进行赔付。
违约金过高的判断因素：
- 仲裁庭在判断违约金是否过高时，会综合考虑多种因素，如合同的履行情况、当事人的过错程度、预期利益等。只有在确有证据表明违约金过高且严重损害了当事人的合法权益时，才可能对过高部分进行调整。
综上所述，被申请人在商事仲裁中主张赔付违约金过高时，应当提供充分的证据来证明申请人的主张不合理。这是被申请人的举证责任，也是维护自身合法权益的重要途径。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。