针对“强令指使多个驾驶人超载运输如何处罚”的问题，我们可以从相关法律法规中找到明确的答案。

首先，根据《公路安全保护条例》（2011年2月16日国务院令第593号）第六十八条的规定，违反本条例的规定，指使、强令车辆驾驶人超限运输货物的，由道路运输管理机构责令改正，并处以3万元以下的罚款。这一条款明确指出了对指使、强令车辆驾驶人进行超限（超载）运输的处罚措施。

进一步地，无论是吐鲁番市人民政府的信息公开内容，还是昔阳县人民政府门户网站上的信息，都确认了这一处罚标准。具体来说，这种违法行为将由道路运输管理机构进行查处，并责令改正，同时可处以最高不超过3万元的罚款。

在执法过程中，相关部门会遵循一系列程序，包括立案、调查、审查、告知、决定、送达和执行等。这些程序确保了处罚的公正性和合法性，也保护了当事人的权益。例如，在作出行政处罚决定之前，会书面告知当事人违法事实及其享有的陈述、申辩和要求听证的权利。

综上所述，强令指使多个驾驶人超载运输的，将由道路运输管理机构责令改正，并处以3万元以下的罚款。这一处罚措施旨在维护公路运输的安全和秩序，防止因超载而引发的交通事故和道路损坏。