国企领导与公司财务有不正当男女关系，如果这种行为违反了公司的规章制度或影响了工作，确实可能会被调查。具体分析如下：

一. 公司规章制度与内部调查

1. 公司规章制度：国企通常有一套严格的规章制度，其中可能包括对员工行为准则的规定。如果国企的规章制度中明确禁止了员工之间的不正当关系，尤其是领导与下属之间的不正当关系，那么一旦这种行为被发现，很可能会触发公司的内部调查。
2. 内部调查程序：公司可能会设立专门的监察部门或纪律委员会来负责此类调查。调查过程可能包括收集证据、询问相关当事人、查阅相关记录等，以确定是否存在不当行为。

二. 可能影响工作与工作氛围

1. 工作效率与团队协作：不正当的男女关系可能会对工作效率和团队协作产生负面影响。例如，它可能导致其他员工感到不适或受到排挤，从而影响整个团队的工作氛围和凝聚力。
2. 公司声誉与公众信任：作为国企，其声誉和公众信任度至关重要。不正当的男女关系如果被曝光，可能会损害公司的形象和声誉，进而影响公司的业务和发展。

三. 法律与纪律处分

1. 法律责任：虽然不正当的男女关系本身可能不构成违法行为，但如果这种行为涉及到了贪污、受贿、挪用公款等违法犯罪行为，那么相关当事人将需要承担法律责任。
2. 纪律处分：如果公司内部调查发现存在不正当的男女关系，且这种行为违反了公司的规章制度，那么相关当事人可能会受到纪律处分，如警告、降职、解雇等。

综上所述，国企领导与公司财务有不正当男女关系，如果违反了公司的规章制度或影响了工作，确实可能会被调查。我建议国企员工应严格遵守公司的规章制度和职业道德准则，避免任何可能损害公司利益和声誉的行为。如有进一步需要，您可以继续咨询我。