在申请强制执行期间公司注销了，需根据注销的具体情况采取相应的法律措施，以维护债权人的合法权益。以下是具体的分析与建议：

一. 核查公司注销的合法性与原因

• 首先，需核查公司注销的具体原因及其合法性，判断是否存在为了逃避执行而恶意注销的行为。若存在非法注销或欺诈行为，仍需追究相关责任人的法律责任。

二. 通知法院与执行机构

• 申请人或其代理人应及时将公司注销的情况通知执行法院或相应的执行机构，并提供注销证明文件，以便法院或执行机构能够及时了解情况，对执行程序作出相应调整。

三. 根据注销类型分类处理

1. 公司依法注销且已清算

    - 若公司已依法进行清算并注销，且清算报告中明确表示公司已清偿全部债务，则债权人通常无法再向公司主张权利。但若债权人有证据证明公司在清算过程中存在隐匿财产、恶意处置财产等行为，导致债权未得到清偿，仍可向法院提起诉讼，要求相关责任人承担赔偿责任。
   

2. 公司未经依法清算即注销

    - 若公司未经依法清算即办理注销登记，债权人可以主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任。法院可根据具体情况变更或追加这些主体为被执行人，法律依据为《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第二十条。
   

四. 评估执行案件的继续性

• 法院或执行机构应评估案件是否具备继续执行的条件，如被执行人（即公司股东、实际控制人等）是否有可执行财产等。若符合继续执行条件，则执行程序继续进行；否则，考虑变更或终止执行。

五. 涉及其他权利人的处理

• 若案件涉及共同申请人、担保人、抵押权人等其他权利人，需确保其权益得到妥善处理。可能需与相关权利人协商或通过法律程序解决其权益问题。

六. 法律责任的承担

• 若公司注销是为了逃避执行或其他法律责任，相关责任人需承担相应的民事责任、行政责任甚至刑事责任。法院或相关机构有权依法追究责任人的法律责任。

我建议，在面对公司注销这一复杂情况时，债权人应保持冷静，积极采取措施，通过多方面的途径去维护自己的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。