新旧外商投资企业法的区别主要体现在决策机制、利润分配、股权转让、合同审核以及过渡期安排等方面。以下是对这些区别的详细分析：

一. 决策机制

1. 旧法（三资企业法）：规定对于修改企业章程、增资或减资等重大事项必须经过董事会一致批准。
2. 新法（外商投资法及公司法）：规定上述重大事项仅需经代表三分之二以上表决权的股东批准通过即可。这意味着，如果外国投资者在中外合资企业/合作企业中拥有的股权比例低于三分之一，他们将不再享有原先在董事会中有关审议和批准上述重大事项的一票否决权。

二. 利润分配

1. 旧法（三资企业法）：合资各方按注册资本比例分享利润和分担风险及亏损。
2. 新法（公司法）：允许有限责任公司按照全体股东的约定进行利润分配。同时，公司剩余财产也按出资比例进行分配。这一变化可能导致现有合同章程规定的剩余资产分配方式与《公司法》规定不符，从而产生问题。

三. 股权转让

1. 旧法（三资企业法）：对股权转让的条件规定较为严格，通常需要其他方一致同意。
2. 新法（公司法）：对有限责任公司的股权转让条件规定更为宽松，半数以上同意即可，且不同意又不购买的，视为同意转让。这一变化使得股权转让更加灵活。

四. 合同审核

1. 旧法（三资企业法）：合资/合作合同需要审批，且合同章程的具体内容也需监管部门干预。
2. 新法（外商投资法）：取消了合资/合作合同的概念，以及合同章程需要审批的相关规定。外商投资企业合同章程审批生效的制度正式结束，监管部门将不再干预外商投资企业的合同章程的具体内容（但涉及国家规定实施准入特别管理措施的除外）。

五. 过渡期安排

1. 旧法（三资企业法）：无明确过渡期安排。
2. 新法（外商投资法）：给予三资企业五年的过渡期，以便企业完成内部组织架构调整。这一安排为企业提供了缓冲期，以适应新的法律环境。

综上所述，新旧外商投资企业法在决策机制、利润分配、股权转让、合同审核以及过渡期安排等方面存在显著差异。这些变化反映了中国对外开放程度的提高和法律体系的完善，同时也为外商投资企业提供了新的机遇和挑战。我建议企业密切关注这些变化，并及时调整自身策略以适应新的法律环境。如有进一步需要，您可以继续咨询我。