法院调查被告的工资情况在亲子鉴定结果非亲生的情况下是合法的。

一. 法院调查取证的法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第六十七条，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。若当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。工资条作为证据的重要性不言而喻，它能够直接反映员工的收入情况，对于解决包括抚养费争议在内的多种民事纠纷具有关键作用。

二. 亲子鉴定结果非亲生时的法律处理

在亲子鉴定结果确认孩子非亲生后，可能会涉及抚养费返还、精神损害赔偿等法律争议。此时，被告的工资情况往往成为确定赔偿金额的重要参考因素。因此，法院有权且有责任在必要时调查被告的工资情况，以确保判决的公正性和合理性。

三. 实际案例与操作程序

在实际案例中，法院已经多次依据相关法律规定，调查了被告的工资情况并据此作出了判决。例如，在涉及抚养费争议的案件中，法院会调取被告的工资单等收入证明，以确定其支付抚养费的能力。申请调查取证的程序通常包括当事人向法院提出书面申请，说明需要调查取证的理由、目的以及所需证据的具体内容。法院在审查申请后，如果认为有必要，会依法进行调查取证。

• 例如，在“笑笑案”中，法院就调取了被告的工资单，以确认其支付抚养费的能力，并最终促成了双方的和解。

综上所述，法院在亲子鉴定结果非亲生的情况下，调查被告的工资情况是合法的，也是必要的。这有助于确保法律判决的公正性和合理性，保护当事人的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。