在父亲要求做亲子鉴定且结果确认孩子是亲生的情况下，鉴定费用的承担通常取决于双方协商或法院判决，但一般原则是由提出鉴定申请的一方（即父亲）承担，除非存在特殊情况或双方另有约定。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则：提出鉴定申请的一方承担费用
在亲子鉴定中，通常是由提出鉴定申请的一方承担鉴定费用。这是因为亲子鉴定是一种特殊的证明行为，其目的在于确认或否认亲子关系，而提出鉴定申请的一方往往是为了满足自己的某种需求或解决某种争议。因此，从公平和合理的角度出发，由提出鉴定申请的一方承担鉴定费用是较为普遍的做法。
二、特殊情况下的费用承担
双方协商一致：
- 如果双方在鉴定前或鉴定后能够就鉴定费用的承担达成一致意见，那么可以按照双方的约定来执行。这种约定可以是口头的，也可以是书面的，但为了确保其法律效力，建议采用书面形式进行确认。
法院判决：
- 如果双方无法就鉴定费用的承担达成一致意见，或者一方拒绝承担应由其承担的费用，那么另一方可以向法院提起诉讼，请求法院判决对方承担鉴定费用。法院在判决时，会综合考虑双方的实际情况、经济能力、鉴定结果对双方的影响等因素，来做出公平合理的判决。
存在过错方：
- 在某些特殊情况下，如果一方存在过错（如故意隐瞒亲子关系、拒绝配合鉴定等），导致鉴定费用增加或鉴定过程复杂化，那么过错方可能需要承担更多的鉴定费用。
三、实际操作中的建议
明确约定：
- 在进行亲子鉴定前，双方最好能够就鉴定费用的承担进行明确约定，以避免后续产生争议。约定时，可以明确费用的金额、支付方式、支付时间等细节。
保留证据：
- 无论是由哪一方承担鉴定费用，都建议保留好相关的支付凭证和发票等证据，以备不时之需。这些证据在后续可能发生的争议中，将起到重要的证明作用。
寻求法律帮助：
- 如果双方在鉴定费用的承担问题上无法达成一致意见，或者一方拒绝承担应由其承担的费用，那么建议寻求专业的法律帮助。律师可以根据双方的实际情况和法律规定，提供具体的法律建议和解决方案。
总结来说，在父亲要求做亲子鉴定且结果确认孩子是亲生的情况下，鉴定费用的承担通常遵循“谁申请、谁承担”的原则。但双方也可以通过协商或法院判决来改变这一原则。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。