当员工产假结束后发现单位倒闭，其赔偿问题主要遵循相关法律法规进行。以下是对此问题的详细解答：
一、赔偿原则与标准
经济补偿：根据《劳动合同法》规定，公司因倒闭与员工终止劳动合同时，应支付经济补偿。经济补偿的计算标准为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。这里的“月工资”指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
产假工资：如果员工在公司倒闭前已经享受了产假，产假期间的工资应按照正常出勤支付。即使公司倒闭，这部分工资也应作为优先清偿的债务之一。
生育保险待遇：若公司为员工缴纳了生育保险，员工还可以享受生育保险待遇，包括生育津贴等。这部分待遇不受公司倒闭的影响，员工可依法向相关部门申领。
二、赔偿程序
协商：员工可首先与公司协商赔偿事宜，包括经济补偿、产假工资及生育保险待遇等。
仲裁：如果协商不成，员工可向劳动争议仲裁机构申请仲裁，以维护自身合法权益。在申请仲裁时，员工需准备相关证据材料，如劳动合同、工资单、社保缴纳记录等，以证明自己的主张。
法律诉讼：如果仲裁结果仍不满意，员工可进一步向法院提起诉讼，通过法律途径解决赔偿问题。
三、特殊注意事项
公司注销：如果公司在倒闭后注销，其法人主体资格终止，相关法律责任也随之结束。但在注销前，公司应依法进行清算，并按照法定顺序清偿所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用等。
个体工商户：对于个体工商户倒闭的情况，员工是否有赔偿需视具体情况而定。如果个体工商户与员工签订了劳动合同，并依法进行了清算，员工可按照法定顺序获得相应赔偿。但如果个体工商户存在违法违规行为，员工可通过法律途径主张自身权益。
综上所述，当员工产假结束后发现单位倒闭时，应依法维护自身合法权益。通过协商、仲裁或法律诉讼等途径，员工可依法获得经济补偿、产假工资及生育保险待遇等赔偿。